在朱由檢的構想中，未來不管是理工學院還是其他類型的高等大學，都將會以超然的方式存在，朝廷相關衙門僅對其具有指導作用，而不是約束和管轄作用。
有事大家可以坐下來談，相關衙門可以提出某方面的意見和建議，但在學術問題上，還是要大學自己說了算。
大學就是研究和討論學術的地方，是一塊凈土，一旦被權勢侵襲，那就會逐漸失去它最初的意義。
理工學院祭酒都將是禮部尚書級，將來其他大學也會依照此例，但級別可能不會這么高。
朱由檢并沒有打算讓方以智從政。
大明不缺官員，但方以智這樣的人才卻是極其稀缺，如果讓他從政，那大明最多就是多一個賢臣，卻會失去一位能夠培養大批人才的良師。
另一位名人朱舜水已經在崇禎十一年被朱由檢安排進了理工學院，現在的職務是人文學院的山長，職級為正五品。
對于這位博采眾長的實用主義人物，用他的思想來影響和改變舉子們陳舊的觀念，這才是最為關鍵的。
朱舜水曾經專門對實用主義做過簡單的闡述。
“所謂實用者，一曰有益于自己身心，二曰有益于社會。”
“為學之道，在于近里著己，有益天下國家，不在掉弄虛脾，捕風捉影。…勿剽竊粉飾自號于人曰‘我儒者也’。處之危疑而弗能決，投之艱大而弗能勝，豈儒者哉？”
朱舜水這種先進的理念和思想，正是朱由檢極為賞識的。
從廠衛暗探反饋的信息來看，在赴任人文學院這三年多來，朱舜水這種實用主義思想，正在被更多的舉子所接受，而隨著笛卡爾等人的到來，更是為實用主義的推廣提供了一個極佳的平臺。
朱由檢有理由相信，只要理工學院能夠創造出更多新事物，在這種示范效應下，務實作風將會在更加廣泛的范圍內得以推廣，理工學院將會成為改變大明的人才搖籃。
但是，要想徹底打破千百年來的某些腐朽思想的禁錮，輿論的引導將會是極為重要的。
引導輿論的大殺器報紙是不是該登場了？
如果把朱舜水、方以智等人的觀點刊登與上，進行大面積大范圍的傳播，在輔以具體的事例，比如各地開荒拓田取得的成效、下鄉舉子中表現優異的一些正面典型、理工學院學以致用誕生的最新成果等等，那對整個社會的潛在影響將會是十分巨大的。
輿論的作用是無與倫比的，來自后世的朱由檢自然是最清楚不過。
但這種足以改變整個世界的武器也是柄雙刃劍，一旦控制不好，未來會對社會造成非常嚴重的危害，說它是洪水猛獸也絲毫不為過。
現在大明辦報紙的技術條件已經具備，無論是油墨、活字印刷書、紙張，甚至是套圖等各項技術已是非常成熟，只要自己把這個創意一講，朱由檢相信，不出數日，一份樣本便會擺在自己的面前。
現在的將作局匯聚了各行業的能工巧匠，再加上四海商行招攬的各種人才，京師的技術力量已經遠超經濟繁榮的江南地區，等到數年后理工學院的首批人才成長起來，各種新生事物就會以雨后春筍之勢茁壯成長，成為大明經濟社會發展的強勁動力。
至于誰來掌管這個治世利器，朱由檢的心里的人選倒是有幾個。
朱舜水、陳子龍、吳偉業、張岱。
這四人都是明末的大才子，每個人的名氣在后世都是響當當的，而支撐名氣的就是他們本身具備的超凡才華。
朱舜水就不必再提，先說陳子龍。
被后世譽為“明詩殿軍”、“明代第一詞人”的陳子龍可以說是上述四人中文學成就最高的。
其特出之才情、文章，與錚錚之民族氣節，毫無爭議的成為明末清初文壇盟主，《明史》中也有他的本傳，稱其“生有異才，工舉子業，兼治詩賦古文，取法魏、晉，駢體尤精妙”。
其詩歌創作，尤其是中后期詩歌創作，旨在繼承盛唐詩歌創作反映現實的精神，特別強調文學創作的社會意義，所以其詩感慨時事，關心民生，雄深豪邁，沉郁頓挫，蒼勁之色與節義相符，同時文辭華美、音韻鏗鏘，浸透著憂國憂民的真摯情懷與高尚的愛國節操，是結束明代復古派詩歌創作的最后一個大詩人。
而這位大名士在歷史上的結局也是十分地悲壯。
在抗清被俘押往南京的途中，途經松江境內跨塘橋時，他乘守者不備，突然投水以死，撈起時已經氣絕，清軍還殘暴地將其凌遲斬首，棄尸水中。時年四十歲。
今年三十四歲的陳子龍正處在人生最好的年華，雖然還沒有經歷前世歷史中那些坎坷，但其才華依舊是冠絕群倫。
崇禎十一年時，在朱由檢的授意下，陳子龍在觀政結束后，被吏部派往南京府為官，從錦衣衛呈送的奏報來看，這幾年陳子龍在本職中還是表現的較為出色，從其處置的幾件案子中可以看出，陳子龍剛正不阿的作風一如歷史上那般，并沒有因為環境太過平順而失去自我。
其實朱由檢把陳子龍打發到南京府，并不是想看看這位名士的治政能力，他的初心是打算看看，在歷史已經徹底改變之后，陳子龍和柳如是能不能走到一起。
崇禎八年兩人短暫同居過，彼此之間的感情還是相當深摯的，這一點從《柳如是別傳》里還是能夠得出確鑿證據的，但令人遺憾的是，兩人終不得諧連理。
這其中的原因有幾個方面。
一是由于陳妻張孺人不能相容，柳亦不愿為妾。
二是由于陳當時經濟狀況不能滿足柳之要求。
要知道作為秦淮河的培育出來的柳如是，過慣了紙醉金迷的生活，從原先那種千人寵萬人哄的狀態，驟然過起了清貧的日子，巨大的心理落差下，柳如是雖然與眾不同，但一時半會還是很難接受的。
這種事其實在后世屢見不鮮。
許多山盟海誓，最終還是敗給了柴米油鹽。
朱由檢認為，除了上述原因外，還有更深層次、更為關鍵的因素，導致兩人最終分道揚鑣。