王允宴請了呂布，呂布同為武人，還是董卓的下屬。王允的刻意奉迎，讓呂布受寵若驚。
在王允旁敲側擊的談話中，呂布不自覺的就說出了董卓向他丟手戟的事情，表現出對董卓的不滿。王允一聽，果然呂布對董卓不是忠心耿耿，便將密謀刺殺董卓的事情向呂布和盤托出。
（漢朝武人的貼身標配手戟，用于近身肉搏。太史慈和孫策單挑時被搶去的就是這種。歷史上曹操、劉備、孫權同樣也用這種手戟。）
呂布有些遲疑道：“如父子何？”董卓在前期對呂布恩同父子，對呂布非常照顧。
王允說道：“君自姓呂，本非骨肉。今憂死不暇，何謂父子？擲戟之時，豈有父子情也？”
呂布考慮再三，還是答應了王允，刺殺董卓。
呂布之所以答應王允，不是因為擲戟的事情，也不是因為呂布隱瞞的私通董卓小妾，而是因為董卓的殘暴。
董卓回到長安后，不但對士人、百姓殘暴，對自己的部下也一樣，只要稍有不對，輕則大罵，重則斬首。
呂布因為一時頭腦發熱和董卓小妾私通，長時間處于惶惶不可終日的日子里。
在漢朝這年歲里，小妾是沒有地位的，有許多人都以小妾為禮物送人，還有許多人因為饑荒和款待貴客，還會殺妾食肉。
按理說以呂布和董卓的關系，區區一個小妾，呂布根本不必這樣。但就是因為董卓的殘暴，讓呂布惶恐不安。
呂布肯同意刺殺董卓，讓王允喜出望外，他明白事成了。
兩人謀劃已定，呂布找來李肅，向他說明刺殺之事，沒想到李肅也毫不猶豫答應了。李肅這種董卓老臣會答應，不但是因為和呂布同鄉，更因為董卓的殘暴已經發展到極致。
由于伍孚的刺殺，讓董卓風聲鶴唳，就連身邊的士兵，只要說錯話，就當場格殺，可以說是人人自危。
董卓自知罪行累累，人人得而誅之，所以董卓不在長安居住，而是在長安城東外的大營居住。
王允等人想在董卓的大營殺董卓，那是不可能的。王允幾人商議，以劉協大病初愈為理由，讓眾大臣依照禮節上朝慶賀。
董卓雖然喪失了進取心，可劉協這塊招牌他是不會丟的，一些君臣禮節董卓還是遵守的。
剛剛經歷刺殺的董卓做足了充分的準備，他在朝服里面穿了重甲，甚至連一般的刺擊都不會受傷；又讓士兵三步一崗，五步一哨分列在大營到長安的路上；同時讓呂布做親衛，護衛左右。
董卓一行人浩浩蕩蕩來到皇宮，這時候董卓的侍衛就不能進去了，但董卓也不怕，因為皇宮中的侍衛早就是他的人了，而且呂布也在身邊，即便有人刺殺，也能支撐到皇宮外的士兵到來。
可惜董卓不知道，在呂布和李肅的配合下，皇宮中的侍衛早就被換成了并州人馬，由李肅統領。
董卓一進宮門，等待多時的李肅便關閉了宮門，率侍衛包圍了董卓。李肅用手戟刺董卓，卻因為董卓的重甲沒有傷到要害，只是劃傷了手臂。
董卓跳下馬車，大呼：“呂布何在？”
呂布說道：“有詔討賊臣。”
呂布的變故讓董卓大怒，喝道：“庸狗敢如是邪！”
呂布也不廢話，一矛將董卓刺死。隨后呂布拿著劉協頒發的赦免文書來到董卓大營，董卓的士兵聽說董卓死了都高聲大呼“萬歲！”。
董卓死后，一直隱于幕后，甚至連呂布想要討伐董卓的詔書都是副手士孫瑞來起草的王允，走到了臺前。
董卓在回到長安后，自知奪天下無望，便一直在考慮后事。他在長安西門二百五十里外修建了一座城堡，號曰“萬歲塢”，世人叫“郿塢”，讓自己的宗族都居住在里面。
郿塢城墻高達七丈，厚度也差不多，董卓在郿塢內囤積了能吃三十年的糧草。董卓想要以郿塢貫徹自己“事成，雄據天下；不成，守此足以畢老。”的方針。同時董卓還聯結馬騰和韓遂，賜予高官，讓兩人認可自己涼州老大的地位。
董卓死后，王允自然不能放棄郿塢，王允讓名將皇甫嵩率兵進攻郿塢。皇甫嵩來到郿塢，郿塢的士兵聽說董卓死了，沒有任何反抗，反而把董卓的宗族全殺了。
涼州馬騰和韓遂得知董卓死亡也是冷眼旁觀，沒有任何舉動。
曾今雄霸一時，虎據司隸的董卓，頃刻間土崩瓦解。
董卓死后，王允上臺，士人們都以為天下將定，士人的政治訴求也能得到施展。
王允上臺后的當務之急便是董卓的舊部，這些人分為長安內和長安外。長安內的士兵因為董卓的壓迫，加上王允頒發的赦免文書和呂布的配合，已經穩定了下來。
長安外的士兵就是董卓當年為了阻擋關東群雄進攻長安，安排在弘農、華陰一線駐扎的涼州精銳。
王允赦免了董卓所有的士兵，收編了長安內的士兵，卻讓長安外的士兵就地解散。
之所以為區別對待，是因為長安內的大部分士兵，前身就是漢朝雒陽禁軍，王允認為這些士兵能受控制。而長安外的士兵都是董卓在控制司隸后，從涼州重新招募的，是董卓的心腹，王允認為這些士兵太危險。
剛得到赦免的涼州軍還沒高興多久，就接到了讓他們解散的命令。這下涼州軍惶恐了，這些士兵都是和關東群雄交戰過的，現在解散容易，如果關東群雄秋后算賬，還不是死路一條。
其實王允也在猶豫怎么解決涼州軍，召眾士人商議的時候，因為董卓死亡，脫困而出的荀攸向王允說道：“涼州人素憚袁氏而畏關東。今若一旦解兵，則必人人自危。可以皇甫義真為將軍，就領其眾，因使留陜以安撫之，而徐與關東通謀，以觀其變。”
荀攸的緩兵之計，王允沒有認可。王允自從刺殺董卓，自認功高蓋世，漸漸驕傲自滿起來。
王允說道：“不然。關東舉義兵者，皆吾徒耳。今若距險屯陜，雖安涼州，而疑關東之心，甚不可也。”