這次軍政會議結束之后，趙子良又在當天下午召集軍中大將們商議軍隊整編之事，從中原帶回來的九萬余西秦軍經過多次整編無論是在作戰上還是在指揮上都很適合當年的情況，因此無須再進行整編，只有一直留在西秦的三萬余兵馬需要進行整編。
趙子良對趙虎、霍堪、魏勐、玄一、玄二等留守的大將們說道：“讓你們過來，就是要跟你們商量留守西秦的三萬軍隊的整編之事！在本王走后這么多年，本王不知道留守軍隊是否一直保持著勤加操練的規定，軍紀上是否有放松，軍械裝備是否每年更換？這些本王都不清楚，本王也沒有在這段時間去各地巡視，以前不管怎么樣，本王不管了，但從現在開始要進行整編整訓，不但留守軍隊需要整編整訓，就連這次本王帶回來的軍隊也需要加大力度進行操練，以盡快適應沙漠、河流、丘陵、山林等各種地形的作戰情況，你們有沒有問題？”
大將們哪敢說有問題、要反對？就算以前放松了，這個時候也應該抓緊了，于是大將們紛紛表示沒問題，一定配合軍機院進行整編和整訓，一些年紀大的士卒或有傷患在身的兵卒肯定要被要求退役。
趙子良見大將們都沒有意見，就接著說道：“好，
這次整編一方面是在編制上進行整編，第二是為了淘汰弱兵，整訓也是為了加強戰力，第三是對軍紀方面進行巡查，有放松軍紀的，要立即收緊口袋，你不收緊口袋，我就給你小鞋穿。整編之后，最大作戰編制為軍團，每個軍團各有番號，視駐防地域和實際情況，每個軍一般為一萬兩千八百人，有些只有九千，有些因為需要，所以兵力會相對多一些，待會你們會各自拿到整編計劃，我給你們兩個月的時間，兩個月之后，我會依次去各地巡視，發現問題我是要打板子的，所以你們最好不要不當一回事！”
眾將答應：“是，大王！”
現在整個西秦的兵馬人數有十二萬人，按照趙子良的計劃，要整編成九個軍團，因為騎兵訓練困難，但在中亞的地形中，騎兵又是主要戰斗部隊，因此騎兵有八萬人，步兵有四萬人，這四萬步兵平時雖然訓練攻城，但以后作戰如果沒有必要一般不負責攻城事宜，攻城事宜由仆從軍負責，這十二萬人馬主要負責野戰和保衛西秦大地。
第一軍團（勐虎）的軍團長是趙虎；第二軍團（蛟龍）的軍團長是白孝德；第三軍團（雄鷹）的軍團長為李晟、第四軍團（餓狼）的軍團長為魏勐；第五軍團（暴熊）的軍團長是霍堪；第六軍團（麒麟）的軍團長是玄一；第七軍團（朱雀）軍團長是玄二；第八軍團（玄武）的軍團長是玄三；第九軍團（獅王）的軍團長是玄四。
除了這九個軍團之外，另外還有三個軍團護衛王宮安全，分別是護衛軍團、近衛軍團和龍衛軍團，其中護衛軍團和近衛軍團各有五千人，而龍衛軍團只有一千人，但這一千人是從全軍之中抽調的身形高大壯碩、極為悍勇之人組成，全身披重鎧、配備鋒利橫刀，是王宮最核心的守衛力量。這三個軍團的組成并非是一成不變的，每隔兩年就要進行重新編練，新的三個軍團編練完成之后就會取代原來的三個軍團護衛王宮的安全。
為了加強西秦的戰爭潛力，趙子良下令實行義務兵和募兵制相結合的征兵辦法，義務兵實行三年制，一年的訓練期和兩年的服役期，年滿之后通過考核之后可以留下成為職業兵，義務兵三年內只有生活補貼而沒有軍餉，職業兵有軍餉，義務兵年滿之后通不過考核則退役回家，義務兵是年滿十八歲的成年男子必須要服兵役，這是強制性命令，不管是王室成員還是平民百姓，都一視同仁。
職業軍人就暫時以這十二萬人為基礎，三年以后，每年會退役一部分，缺額則由義務兵中通過考核者補充進去，始終讓職業軍人的數量規模維持在十二萬人左右。
當然，這是和平時期，在戰爭時期，義務兵完成訓練之后也要上戰場，如果兵力不足，則還要進行緊急動員，以前退役的軍人都必須服從征召返回軍隊參加作戰。
趙子良按照中原朝廷的規矩和習慣，每月初一和十五召開軍政大員們商議解決軍政大事，平日里則各自辦公、處理公務，有重要的事務、無法解決和做主的事情則向他請示。以前的節度使府被他改稱為王庭，而其他各中樞機構衙門則各自在恒邏斯城內找辦公地點。
上元元年二月初一，軍政主要大員聚集在王庭，參加小朝會，趙子良與眾人一起商議決定軍政大事。
“臣等拜見大王！”王庭之下的兩院兩衛一寺一府的主要大員看見趙子良走過來之后都下拜行禮。
“都免禮吧！”趙子良坐下后抬了抬手。
“謝大王！”
主要軍政大員一共十人，
都聚集在這里，分別是劉眺、獨孤峻、高尚、岑參、高適、楚歌、李嗣業、鄭三、趙虎、陳青。
趙子良問道：“這都半個月過去了，王庭中樞各衙門機構都組建得如何了？”
劉眺站出來拱手道：“啟稟大王，政務院及其下屬衙門機構已經全部組件完成，三天前就已經開始重新處理公務！”
接下來其他各中樞衙門機構的主要官員和將領都分別依次站出來稟報各自衙門的組建進度，基本上都完成了構架的組建，開始步入正軌。
趙子良聽完之后說道：“很好，本王決定把昆凌都護府、池都護府、碎葉都護府和泰西都護府這四個建制之下的城池改為縣制，一城為一縣；另外把泰西都護府一分為二，把昭武九姓之地的粟特人居住之地設立為康居都護府，把吐火羅人居住之地設立為月氏都護府，如此一來就有五個都護府，每個都護府轄下的縣有多有少，本著一城一縣的原則，中樞其他衙門機構要迅速在各縣派駐辦事機構，在五個都護府治所的所在城池要設高級辦事機構，稱為某某廳，例如錦衣衛在薩末腱城要設錦衣衛廳；在縣城設立中級辦事機構，錦衣衛要在縣城設立錦衣衛房；有些縣還有好幾個鎮，錦衣衛也要在鎮一級設立低級辦事機構，稱為錦衣衛所，其他各他們也是同樣如此。政務衙門則無需這般稱唿，直接叫都護府、某某縣衙、某某鎮。另外軍機院也要在各級行政區設立辦事機構用于駐軍、征兵、撫恤等事宜。政務院要盡快把各級行政區的行政編制報上來，其他各中樞機構也要盡快把派出機構派到下面兩級行政機構，都明白嗎？”
眾人抱拳拱手道：“明白！”
這時劉眺站出來道：“大王，以前我們只有五萬多、不到六萬兵馬，現在我們多了近一倍的軍隊，軍費開支會大大增加，這會給我們的財政帶來很大的負擔！”
趙子良問道：“那么你的意思呢？”
劉眺道：“臣下以為應該削減一些軍隊！”
趙子良看向鄭三，問道：“按照我們現在的兵力人數，每年需要多少軍費開支？”
鄭三算了算，站出來抱拳道：“大王，如果每年都要更換裝備，每年大約需要八百萬貫！如果兩年更換一次裝備，則只需要五百萬貫”。
趙子良又問劉眺：“劉大人，以前我們一直沒有向當地居民百姓收過稅，只向過路的商旅收稅，去年的財政收入是九百萬貫，本王沒說錯吧？”
劉眺道：“是的，大王！”
趙子良說道：“咱們統治這里已經這么多年了，卻一文錢的稅都沒有向當地居民百姓征收過，我們從今年開始向當地居民征收賦稅，不算過分吧？他們如果不交稅，我們憑什么保護他們的人生安全？憑什么保護他們的財產安全？”
劉眺道：“大王既要征稅，也是可行的，這么多年過去了，我們在這里的統治已經穩固下來，現在我們漢人的人數在這里占多數，只要漢人都交稅，其他各族就不能不交稅！”
“很好，你算算，如果我們收稅，今年的財政收入可以達到多少？”
劉眺算了算，拱手道：“如果過往商旅的稅收維持不變的情況下，大約可以收到兩千五百萬貫！”
趙子良又道：“本王用一千萬貫維持軍隊數量和戰斗力，以達到我們維持這里統治的目的，過分嗎？”
“這既然大王這么說，臣下無異議！”
趙子良問道：“府庫還有多少銀錢？”
劉眺說道：“除去留守駐軍軍費開支和官員們的薪俸、官府辦公費用等等，府庫的賬目上還剩下兩千一百萬貫！”
趙子良聞言笑道：“看來諸位大人都是能積攢財富之人，這么多年的稅收除去你剛才說的這些開支，你們基本上沒有亂花。這一點我要稱贊你們，對你們表示感謝，但是我又要責怪你們，因為你們不明白，對于官府來說，錢是越用越有，官府如果把賦稅積攢起來不用，百姓們去哪兒賺錢？各地每年出產的金銀銅是有數量的，也會有損耗，你們把錢藏起來不用，老百姓就賺不到錢，錢需要流通才能發揮它的價值，明白嗎？官府把錢花出去，老白西瓜賺到了錢才能買東西，商家才能生產和運輸貨物去賣給百姓，官府才能再收稅，錢財流通的速度越快，官府收到的稅收就越多，反之則相反。所以我們要把錢都花出去，讓老百姓有錢賺，如何花？這就是我們接下來要說的問題了！”