撤離云州星的命令傳達下去之后，前進艦隊所有單位立即開始進行撤退前的準備，大量的物資流水一般送上戰艦，無數機械人忙得團團直轉，愿意和艦隊一起撤走的克隆人全部送上戰艦冷凍起來。
雖然克隆人只在云州城里生活了一年多的時間，但這里是他們家園，國人固有的鄉土情節難以避免地出現在克隆人身上，愿意跟艦隊走的只有三分之一不到，剩下的克隆人寧肯面對亞特蘭蒂斯人的炮火，也不愿意離開自己的家園。
葉飛沒法強迫他們，也沒有能力帶走所有的克隆人，除了給他們留下一批機械人之外，能做的就只有再給他們留下一批武器。
所有人心里都知道留下的克隆人不是亞特蘭蒂斯人的對手，不過擁有一些武器，多少能帶來一點安全感。
在這方面葉飛倒是一點也不吝嗇，甚至拆下了戰神號上三分之二的晶體導彈，另外還有近千枚光速魚雷。
ym174一役沒用上光速魚雷，各艦的儲備基本上都沒怎么動用，加上云州星這幾個月的產量，一共也就是一千五百枚左右，留下這批光速魚雷之后，每艘戰艦的備彈只剩下二十枚而已，還不到正常基數的一半兒。
艦隊是要撤離云州星，而不是執行作戰任務，完全沒有必要帶那么多光速魚雷，而且省出來的空間還可以帶上一些必要的物資，比如從基地星帶回來的超重元素晶體。
十幾個小時之后。從湖州星逃出來的五艘戰艦逃回云州星，段平立即安排一批機械人對這五艘艦隊進行全面檢修。
除了云州星之外，就只有地球邊緣的臨時基地擁有維修戰艦的能力，不調整好戰艦的狀態，萬一在飛向新星系的過程中出了什么故障，就只能放棄寶貴的戰艦。眼下整個前進艦隊只剩下二十三艘戰艦，葉飛一艘戰艦也損失不起。
唯一值得慶幸的是湖州艦隊從來沒擁有過戰神級戰艦，缺乏補給戰神級的的經驗，因而葉飛派往湖州星的全部是天鷹級戰艦。
不過這點便宜不提也罷。
前進艦隊忙得腳打后腦勺，亞特蘭蒂斯艦隊也好不到哪兒去。
一直躲藏在云州星附近。監視云州星的亞特蘭蒂斯戰艦很快就注意到了云州星的異常。得到消息的微里安德和支援艦隊輕而易舉地判斷出云州星的人類艦隊很可能是要逃跑，可限于戰艦的速度，短時間內根本趕不到云州星，只能一邊全速飛向云州星。一邊盼著云州星的異常不是為了逃走。
不過他們再怎么著急也沒有用。戰艦的速度跟不上。就只有干瞪眼兒的份兒。
別看亞特蘭蒂斯人從地球上抓走了不少人類，可是除了核武器的制造方法之外，挖空心思的亞特蘭蒂斯人再沒能從人類身上得到丁點好處。
亞特蘭蒂斯人最感興趣的就是人類戰艦的動力系統。可惜從地球上得到的是磁力引擎技術，速度最高只有百倍光速，根本就不是他們想要的。
出現這種情況一點不奇怪，共和國軍方得到超重元素晶體原本就是機密中的機密，知情的不是派到遠離太陽系的戰艦上，就是派到了獵戶座大星云，留在地球上的兩億國人壓根兒就沒誰知道這個情況，外國人就更不要提了，國家安全局和總參二部的能力還是很強的。
話說回來，就算讓亞特蘭蒂斯人知道晶體引擎的詳情，他們也沒地方開礦，照樣還是干瞪眼兒沒轍。
2216年9月1日，湖州星遭到襲擊的三天之后。
在段平的指揮下，兩艘只建好骨架的戰艦按計劃完工，除了百十平方的駕駛艙之外，長達十五公里的巨艦再沒有壓力空間，丑陋猙獰的外殼到處支楞著不堪入目的邊角零碎，而且為了加快速度，原本只打算用來堵漏的“冰凍法”被大量應用于外殼的建造，只要有一束光芒掃過這兩艘戰艦，就會映出一片星空般的反光。
這兩艘戰艦實在是太粗糙了，葉飛根本不敢把冷凍的艦員或者克隆人裝進去，也不敢存放至關重要的糧食給養，只能存放不重要的物資，主要是以機械人為主。
經過兩年多的建設，云州星系擁有機械人上數百萬臺，將這兩艘戰艦塞滿綽綽有余。
物資的搬運又持續了兩天，直到9月3日，艦隊才將將做好撤離的準備，沒法撤走的宇宙基地和衛星工廠干脆塞上核彈，不過葉飛并沒有爆破這些設備，而是將引爆的權力交給了留在云州星上的克隆人。
假如亞特蘭蒂斯人沒有襲擊云州星的話，克隆人完全可以將這些基地和工廠利用起來。
段平對此很不理解，他很擔心克隆人會在艦隊離開之后投靠亞特蘭蒂斯人，他不希望這些設備落在亞特蘭蒂斯人手上。
不過葉飛很有信心，因為無論宇宙基地還是衛星工廠內的爆破裝置都連接在共振通訊儀上，萬一出現不可控的情況，直接遠程引爆就完事了。
2216年9月3日晚七時，葉飛率領前進艦隊離開云州星。
此時亞特蘭蒂斯人的艦隊距離云州星還有兩天的航程，監視云州星的敵艦在艦隊即將啟航的關鍵時刻沖入云州星，試圖拖住艦隊撤離的腳步。
為了偵察人類的情況，亞特蘭蒂斯人放出了二百多艘戰艦執行偵察任務，發現云州星之后，不少敵艦聚集到云州星附近，大概有十幾艘的樣子。
十幾艘三角戰艦的出現讓葉飛錯以為是大批敵軍即將到來，毫不猶豫地下達了出發的命令。
以戰神號為首的二十三艘戰艦外加兩艘粗制濫造版的運輸艦迅速進入超光速狀態，直接扔下了一點辦法都沒有的監視艦隊。
離開云州星之后，前進艦隊兵分兩路，一路直飛允州，另一路飛往凌州，兩支艦隊將在這兩顆殖民星停一段時間，按照云州星的方法帶走自然人，安置克隆人。(