穹源元年元旦，飛馬鎮在參加完開國大典的閱兵式后，立刻整軍從居庸關出關，護送一個協的援軍和糧草補給等物資，至遼東寧遠、鎮遠兩城。
因為此次行動出其不意，這一路并未遇敵，只是北地極寒、積雪盈尺，造成駝、馬等大批倒斃，也造成了相當多士兵凍傷。
而在歸來時，飛馬鎮更是帶回近萬逃亡而來的遼東軍民。這使得寧遠、鎮遠兩城基本消弭了內間作亂的威脅，讓遼東的余繼等人，能集中全部軍力防備清軍的來襲。
這次護送行動，也極大地鼓舞了鎮遠、寧遠這兩城軍民的士氣。這讓他們相信：吳世恭絕不會拋棄他們。也使得兩城軍民有了堅持下去的勇氣。
但也是這次護送行動，立刻讓滿清方面警惕了起來，他們也將調集大軍，要盡快地把寧遠、鎮遠這兩城拔除。
至此，圍繞著山海關、寧遠、鎮遠的二城一關大戰正式拉開了序幕。而這場集中了清軍和大平軍主力的大戰，就貫穿了整個穹源元年。
為了獲得此次大戰的勝利，大平軍把大多數的精銳都調了上去。而且在兵源補充、糧草補給、軍械供應等方面，完全傾斜至此條戰線，甚至都不惜犧牲掉其他幾路大平軍的后勤供應。
先不提此場大戰。因為讓吳世恭等人完全跌破眼鏡的是，幾乎沒有得到任何支持的，兵力又不足的其他幾路大平軍，先是讓山西的大順軍主力崩潰，再是將四川的大西軍殲滅，連李自成和張獻忠這兩大梟雄也相繼授首。
而這一場場出乎意料的大捷，完全給了吳世恭等人以極大的驚喜。沒想到到了最后，連南明都很快土崩瓦解了。所有人都沒想到，主戰場的敵軍還未解決，可次要戰場上的敵軍卻相繼覆滅。真是人生無處不驚喜啊！
最后來說說南明戰場吧！
當穹源元年元旦。吳世恭登基的時候，他所控制地盤上的治安，可以說是相當混亂，境內盜匪橫行。整個北直隸、山西、山東以及河南、湖廣的大部分地區。除了一些重要的城池，鄉野間簡直就是一副無政府狀態。小股盜匪多如牛毛，有幾股勢力較大的匪盜，甚至都敢攻打縣城，根本無懼于大平朝廷的威嚴和大平軍的鐵拳，真的是把“吳屠夫”的外號當成耳旁風一樣了。
不過形成這樣狀態的原因也是多種多樣的。其中有：大順軍和清軍肆虐整個大明朝的中北部，造成了原大明基層官府都被摧毀和癱瘓；連番大戰影響了耕種，造成了中北部的饑荒；大量的潰兵散至民間，落草為寇；一些忠于前明的官紳組織的抵抗軍；邪教橫行；歸降于大平朝的軍隊軍紀敗壞，平日里行事猶如匪盜；汝寧軍崛起速度太快。許多非河南官紳百姓根本不知道吳世恭的威名；對于大平朝是否能夠延續下去，有著很大的懷疑等。
因此，此時的大平軍，他們即與大順、大西、南明和清軍同時開戰，又要在內部剿匪治安。有種以一獨戰天下群雄的感覺。
對此窘境，大平朝也只能采取逐步肅清的方法。因為投降過來的雜牌軍隊軍紀太差，讓他們剿匪其實就是逼民為匪。于是大平朝就采取編練一支，再放出一支的方法，所以一開始投入到剿匪的兵力并不多。
可是隨著《大赦令》、《招賢令》等法令的頒布，再加上大平朝官員體系的建立，吳世恭又下撥了一部分賑災銀糧。匪盜橫行的局面就很快得到了控制。
而到了穹源元年五、六月間，征西軍剿滅大順、大西，先后斬殺李自成和張獻忠的消息傳遍天下以后，許多地區的匪盜竟然都是驟然不見。許多盜匪都是藏好了兵器，躲入了民間，偃旗息鼓了起來。使人感到宛若神明降臨。
隨之，《禁荒令》等三項法令得到了嚴格的實行，中北部地區也建立起了大批的屯田莊子，所有的流民都得到了安置和管理，甚至還在屯田莊子中。逐漸編練了近百萬護莊隊。在這樣的情況之下，大平朝內部的治安終于得到了基本穩固。
可就是在這樣的情況之下，有一個地區依然是群匪紛立，而那個地區就是――山東。
在歷朝歷代中，山東歷來是造反的“重災區”。宋朝時有著水泊梁山、金朝時反金、元朝反元、明朝反明，反正是誰當權，山東人民就造反誰。
這是因為歷朝統治者對山東確實壓榨太狠，比如明朝就在山東實行馬政。還有就是白蓮教及其變種的邪教橫行。就是時至今日，還有要電話號碼的呢。
自從明末以來，山東一省地方性的農民造反就連綿不斷，明朝官府的統治其實已經很不穩固。等到清軍進入山東以后，當地的很多百姓都開始武裝抵抗。而等到清軍撤出以后，這些武裝農民又同官紳勢力作對了起來。許多地區都被這些造反的隊伍給實際控制了。
而此時山東巡撫顏繼祖和山東總兵劉澤清急于向大平朝歸順，他們也無心治理地方。等到他們入京歸順大平朝以后，山東地方的官府更是處于一種群龍無首的狀態。
不過更令人費解的是，南明弘光朝野卻是忙于“繼統”風波，沒工夫理會接收山東地區，因此，這里的匪亂也有種愈演愈烈的架勢。而且其中的勢力混雜，互相爭斗，暫時形成了一種權利真空狀態。
在穹源元年新年前后，靠近北直隸的冠縣在大順縣令逃跑后，有土賊裴守政、馬瑞恒、劉桐相等蜂起；原明朝設置在登州的防撫曾化龍也掌握部分兵力，盤踞地方；
正月間，靈山衛義軍張大雅、張千出、韓繼本，高密縣義軍單之賞、張宇等部圍攻膠州；
二月，熊正恩等統兵（一個鎮一萬五千人馬）擊退賊軍，解膠州之圍。昌邑縣土豪李好賢率眾向曾化龍投降，張大雅、張千出被擒殺。可是，曾化龍得知大平軍占領京畿以后，卻丟下防守地區，同膠州知州郭文祥一道航海南逃。膠東地區處于無政府狀態。大平軍在二月下旬輕而易舉地接管了該地。