在堡壘軍議的一開始，吳世恭就首先宣布了三項決定：
第一個決定就是：正式確定了吳世恭手中所有兵丁的編制。
首先就是騎兵。吳世恭和薛永利把手中的騎兵分為了五個中隊。每個中隊指揮五個小隊。每個小隊十名騎兵。騎兵的總隊長為薛永利。
但騎兵中，有兩個中隊的任務是比較得特殊的。其中一個中隊是由張彪和李三河為正副中隊長的騎兵偵察中隊。另一個是由吳世恭和薛永利親自指揮和訓練的騎兵預備中隊。
因為在這次編制的制定中，吳世恭和薛永利抽調了身邊近五十位護衛，下放到新兵丁和周巡的民團那里成為軍官，再從新兵丁中挑選了五十名優秀的兵丁，作為自己的親兵。
而這些親兵，都將接受騎兵的訓練。吳世恭從京城里帶來的賭坊護衛，雖然已經接受了吳世恭雇用的老軍頭近一年的騎術訓練，但是到了千戶所堡壘以后，還是接受了薛永利的加強訓練以后，才勉強地成為了一名合格的騎兵。所以，吳世恭知道，騎兵訓練周期是相當漫長的。這些親兵起碼要接受半年以上的嚴格訓練，才能夠成為一名合格的騎兵。
其實，現在的吳世恭，已經把自己那個騎兵大隊，作為自己軍隊的軍官團來培養了。一旦這些騎兵所有科目的訓練都合格以后，就會把他們下放到各個部隊去當中低級軍官。
而那四百名新兵丁，吳世恭就成立了四個步兵中隊。每個中隊下轄十個步兵小隊。每個小隊同樣也是十名兵丁。步兵部隊也成立了一個大隊，由吳世恭直接指揮，錢綺成為副手協助吳世恭訓練這些步兵。
在這次戰斗以后，雖然基本上所有的新兵丁在戰斗中，連和圣靈會亂民的接觸機會都沒有一個，但是，因為他們都經受了戰爭的氣氛，吳世恭還是破例不看考核成績了，把所有的新兵丁都轉為正式的兵丁，也就是都拿五成軍餉的兵丁。
當然，考核的過程還是進行了一次。吳世恭還要在他們之中挑選最優秀的五十名兵丁作為自己的親兵呢。這些親兵也將獲得全餉。并且，如果這些親兵能夠完全掌握了騎兵的各種騎術科目，也將會得到象京城來的護衛一樣的雙倍軍餉。
另外，吳世恭還在那些沒有成為親兵的兵丁中宣布：以后每過三個月，都將會再考核一次，再挑選出一部分優秀的兵丁作為吳世恭的親兵。
這樣一來，吳世恭就在自己的軍隊中，利用軍餉的差別，形成了一種等級制度，也給了每一位兵丁一種奮斗的目標，讓他們有了努力訓練的動力向上爬。
而周巡的民團也將會分為三個中隊。其編制也和步兵中隊的編制一樣。但是他們的軍餉和供養，靠著那七千畝土地的產出，在平常日子里可能勉強夠用了，但是在這個災荒的年景里卻絕對不夠，所以吳世恭也將會拿出一部分銀子，作為對民團的軍餉和供養的補貼。
除此之外，民團的訓練標準、考核標準和晉升標準，將和吳世恭其他的兵丁完全一樣。這樣的話，一方面民團的兵丁也有了努力訓練的動力；另一方面，吳世恭將通過軍餉的發放和以后兵丁之間的調動，切實地把民團的武力抓在自己的手中。
當然，還有梁輝他們的炮隊。現在因為火藥的供應總是不足，所以炮隊也只能夠維持一個最低水平的訓練標準。
吳世恭就要求炮隊所有的人，也要去參加步兵和騎兵的訓練。當然，他們的訓練標準和強度將會有些降低。
吳世恭之所以弄出“中隊”，“小隊”這些不倫不類的稱呼，也是沒有辦法的。因為在他的那個千戶所，所有的百戶、總旗和小旗的官職都是世襲的，而且現在這些官職也都有那些軍戶占據著。
而吳世恭自己卻并沒有任命新的武職官職的資格，所以，吳世恭也只好用這些暫時的稱呼來命名手下的那些軍官。
第二個決定就是：吳世恭和薛永利確定了各個小隊和中隊的帶隊軍官。在分派的時候，吳世恭特意把每個中隊的正副中隊長，都分別安排：一位是薛府護衛出身；另一位就是賭坊護衛出身。這樣的安排，只是出于防范下屬異心的一種預防措施。
唯一例外的就是張彪和李三河。現在的吳世恭太缺少有經驗的偵察人才了。不過，這樣安排的問題也不大，畢竟張彪和李三河手下的部屬全部都是吳世恭的護衛出身。
第三個決定就是：就是再新招收四百名新兵丁。
吳世恭現在是這么盤算的，就算是自己的五哥吳世文成為不了這個縣城的縣令，那么退一步來說，自己讓給五哥的功勞就沒有什么用了，這些功勞也將會還給自己，讓吳世恭獲得歸德衛守備的官職。
而就算是最壞的打算，吳世恭成為歸德府的守備了。在和李祿分手的時候前，吳世恭已經向李祿打聽過守備的基本情況。
吳世恭就琢磨著：自己就算是和李祿這個擠出來的守備一樣，只有八百名兵丁的額度，朝廷也只發下五成的軍餉，那自己多養四百名新兵丁的銀子總算是有的。再說，新兵丁的訓練工作，早開展一天也可以好一天嘛。
至于如果五哥吳世文獲得了縣令的官職，那就更沒有問題啦！在五哥吳世文的幫助下，自己多養四百名兵丁又算是什么大不了的事情呢？
當吳世恭宣布完決定以后，接著，大伙兒開始進行了總結會。對于吳世恭要加強兵丁訓練，新招收兵丁的決定，所有參加會議的人都一致贊同。
當吳世恭剛剛到千戶所的時候，吳世恭花費大量的銀子和動員大量的人力建造千戶所堡壘，并且招收兵丁，加強訓練。所有人對吳世恭的這種做法確實有些搞不明白。因為，當時千戶所周圍的局勢還是很平穩的。
可是半年時間都不到，卻發生了這么大規模的一次造反。平心而論，要不是吳世恭早作準備，不要說這次的造反能不能得到平息，就是吳世恭這些人能不能保住平安都不一定呢。
因此，對于吳世恭現在擴充武力的做法，所有的人現在都完全同意。
另外，與會的人還總結出了以下一些觀點：
第一就是要大力發展騎兵。通過了永別了沖鋒，經過訓練的騎兵的威力，已經完全釋放出來了。應該說，這次剿滅圣靈會亂民造反的首功，就是吳世恭的這些騎兵。
但是，吳世恭也知道，一時三刻大量地增加騎兵，自己的財力也肯定吃不消。吳世恭采取的方法就是，寧愿人等馬，不讓馬等人。因此，他才會要求新的親兵，都要接受騎兵的訓練；
第二就是要多制造火銃。在這次縣城的防御中，所有人都看到了火銃在防御作戰中的作用。并且，吳世恭他們還發現，火銃對于那些沒有見到過火銃的亂民來說，心理威懾的作用也十分的巨大；
在目前，楊狗蛋那個鐵匠作坊的人手也不足，吳世恭就想著讓他盡量多制造一些火銃。
不過，在這次從圣靈會繳獲的銅錢當中，還有幾大塊銅塊，那銅塊都是被圣靈會亂民敲碎的銅佛像碎塊。吳世恭就讓楊狗蛋等有空的時候，把那些銅塊給融化了，試驗性質地去鑄造一門小炮來；
第三就是要加強隊列的訓練。吳世恭這次在齊縣令這個縣城里，訓練那些召集起來的青壯時，在進行讓他們先并排跑，然后刺殺的訓練項目，而這些青壯都做不到。吳世恭就發覺，隊列的作用其實就在這里。
除此之外，吳世恭發覺自己的“縮頭烏龜流”的想法，看起來好象十分的美好，可是在實際中卻根本就做不到。在這次作戰中，吳世恭又要防御齊縣令這個縣城，又要去救援歸德府城，根本就沒辦法在自己的千戶所堡壘里縮著。
因此，吳世恭適當地改變了自己的戰略，就是依托千戶所堡壘這個要塞防御為主，有限地向周圍地區支援進攻。
而配合著這個戰略的改變，吳世恭一方面要加強自己的騎兵，另一方面也要加強自己的步兵的野戰能力。起碼這些步兵要有押送繳獲的物資和俘虜的能力。這一次作戰，發生了薛永利只有一百五十名騎兵，卻要押送幾千名俘虜，還有那么多物資的情況，這也太窘迫了一些吧。
另外，還有周圍地區的地圖繪制。以京城來的護衛為主的吳世恭軍隊，除了幾條大路，就根本就不熟悉這里的地形。如果以后要進行有限的進攻的話，沒有地圖肯定不行。
吳世恭一方面讓薛永利安排下去，讓那些熟悉當地地形的新兵丁，幫助地圖的繪制，另一方面，讓張彪和李三河在會議結束以后，立刻率領他們的偵察中隊，到附近去觀察地形，繪制地圖。
當然，以吳世恭現在軍隊士兵的文化水平，繪制現代那種帶有等高線的標準軍用地圖，那就是根本不可能的。更不用說做什么沙盤了。吳世恭要求他們繪制的，也就是那種可以說明基本地形的簡要地圖罷了。
這次堡壘軍議，讓吳世恭在軍隊的正規化建設中，跨出了第一步。也基本上體現出來了吳世恭的建設軍隊的基本思想。
但更為主要的是，吳世恭的軍隊，從堡壘軍議以后，養成了在每次戰斗以后，都進行戰斗總結的慣例。吳世恭的軍隊，也成為了一支能夠在戰爭中學習成長的軍隊。