盟國在華盛頓召開會議已經不是什么秘密了，隨著大量的情報傳回日本，大本營方面暴怒的同時立即商討對策。
按照情報部門總指揮官土肥原的想法是，不管華盛頓會議最終會做出生么決定，真正對大日本帝國有影響的也只是支那戰場，南太平洋戰場大局已定，以美英等國的情況暫時不會對帝國造成致命的威脅，因此只需要重點關注支那政府就可以了。
另外，土肥原認為支那領袖這次前往美國，對于大日本帝國來說是一場除掉他的大好機會，因此建議大本營不惜一切代價攔截蔣，最好是能將其活捉。
大本營經過慎重考慮，覺得土肥原的建議很好，因此責令土肥原的情報部門一力承擔此事，不惜一切代價在海空兩路攔截支那領袖蔣，同時責令南方軍加快進攻速度，爭取早日結束南太平洋方面的戰事。
接到大本營的命令之后，日本南方軍迅速行動，按照南方軍的作戰設想，南方軍先以進駐泰國的第25軍為先鋒部隊，迅速作好進攻緬甸的準備，在作戰初期相機摧毀南部緬甸的敵空軍基地，保證日軍在馬來方面作戰部隊的側背安全，然后攻占仰光附近，摧毀英蔣合作的據點，待作戰告一段落后，再增加兵力擊潰駐緬甸的英軍，加強對中國和印度的壓力。
同時再以第16集團軍向荷屬東印度發動進攻，以爭取在最短時間內占領盟軍在南太平洋上最大的油料基地。
此外、還要集中海軍力量。對盟軍在南太平洋僅存的海軍艦隊進行最后的打擊，占領爪哇島。
進攻緬甸，南方軍決定以第33師團和第55師團主力為基干兵力，承擔上述作戰任務，并且由飯田軍司令官為最高指揮官。飯田軍司令官抵達曼谷后，按照南方軍司令部的命令，對陸續到達的部隊作了周密部署。
命令原為確保泰國安定暫歸該軍指揮的近衛師團，于9月24日以后由鐵路運輸歸復原來建制；令由鐵路和行軍到達的第55師團主力在達府、麥索一帶集結，以其一部在北碧西部地區集結；另外命令第33師團在達府附近集結，隨時準備進攻緬甸。
與此同時。在占領新加坡之后。日軍第16集團軍迅速在蘇門答臘和巴厘島登陸。在正面擺開架勢，向荷屬東印度發動進攻。
面對日軍的進攻，盟軍方面亂作一團。由于蘇門答臘島和巴厘島只有荷蘭的一個師防守，五百英里長的爪哇北部海岸實際上向日軍洞開。美英荷澳聯軍空軍力量現在削弱到只有五十五架戰斗機和八十五架轟炸機。海軍力量有八艘巡洋艦、二十二艘驅逐艦和幾個潛艇縱隊。澳大利亞面臨的威脅越來越大。
印度英軍總司令韋維爾向倫敦方面發了一封電報。估量了遠東的暗淡前景，電報最后說：“失去爪哇，雖然無論從哪一種觀點來看都是一個嚴重的打擊。但并不是致命的打擊。因此不應作出努力來增援爪哇，那樣做可能危及緬甸和澳大利亞的防御。”但是，韋維爾的建議并沒有引起丘吉爾內閣的重視。
連續不斷的噩耗讓英國人以及英聯邦成員對丘吉爾內閣失去了信心，他們極為懷疑丘吉爾首相和他的幕僚們是否還有辦法控制“一連串的災難”，這一連串的災難現在不僅威脅著澳大利亞次大洲，而且也威脅著印度。
再加上英國首相丘吉爾和澳大利亞柯廷總理不和，柯廷在聽到新加坡失守的消息后，立即召回正在橫渡印度洋運送澳大利亞第一師的護航運輸船隊。而丘吉爾隨即發出電報，命令護航運輸船隊改道駛往仰光，并且告訴柯廷：“在這個危險時刻，美國必定給你提供最大的支援。”
盡管羅斯福總統保證派遣更多的部隊，澳大利亞總理和他的內閣仍然無動于衷，堅持要求運兵船隊必須返回，他們認為首要的義務是拯救澳大利亞，他們還認為澳大利亞必將成為對抗日本侵略者的最后的基地，不管是荷屬東印度還是緬甸都已經沒救了。
9月24日上午，美國的老牌航空母艦“蘭利號”運送一批戰斗機前往芝拉扎的時候，被日本飛機發現并擊沉。隨后日軍聯合艦隊一部向爪哇海靠近，試圖在爪哇北海岸登陸，爪哇海戰爆發。
日軍企圖以菲律賓和馬來亞為基地實施兩翼包圍，首先攻占荷屬東印度外圍島嶼，奪取制海制空權，爾后集中兵力消滅盟軍主力，攻占主島爪哇島，掠奪石油資源，支持其侵略戰爭。
參戰日軍為第16集團軍，司令官為今村均中將，轄第2、第38、第48師團及第56獨立混成旅團等，總兵力共約10萬人，配合作戰的有日本聯合艦隊第3艦隊、第11航空艦隊和陸軍第3飛行集團，各型作戰飛機約540架。
而盟軍方面是由美、英、荷、澳組成盟軍戰區司令部，司令為英國陸軍上將A.P.韋維爾。盟軍駐荷屬東印度的兵力有陸軍9.2萬人，主要以荷蘭軍隊為主，有7.5萬人，海軍作戰艦艇88艘，空軍作戰飛機約300架。
聯合海軍部隊的司令是美國T.C.哈特海軍上將；陸軍部隊的司令官是荷蘭陸軍中將H.塔.普爾頓；空軍部隊的司令官是美國陸軍航空隊L.H.希里爾少將。因只有一名荷蘭軍官參加這個聯合司令部，而使得荷蘭人深感失望。
盡管美英兩國的海軍都遭受了前所未有的重創，但是殘存的海軍艦隊還是十分強大，集中在荷屬東印度的這支艦隊擁有重巡洋艦“休斯敦”號、輕巡洋艦“馬波亥德”號，性能極佳的新式輕巡洋艦“波伊斯”號以及13艘驅逐艦，以及澳大利亞的2艘輕巡洋艦和7艘驅逐艦，康拉德.赫爾弗里中將指揮的荷蘭海軍艦隊擁有輕巡洋艦“特隆普”號、“爪哇”號、“魯特”號，7艘驅逐艦和16艘潛艇。
而且，美海軍第10巡邏機大隊的轟炸機，荷蘭的戰斗機以及爪哇基地上的B－17空中堡壘轟炸機，隨時準備為盟國聯合海軍艦隊提供空中掩護。唯獨有一點令這些將軍們很不滿，那就是那些可惡的中國人竟然拒絕了羅斯福總統的邀請，沒有讓那支據說很強大的海軍艦隊南下配合他們作戰，簡直是不可原諒。
9月24日上午，準備在泗水登陸的日軍第四十八師團搭乘在41艘船上，由水雷戰隊和驅逐艦隊護航下，從巴厘巴板出發，殺氣騰騰地沿爪哇海面南下，一場決定盟軍能否在南洋群島一帶安身立命的爪哇海戰一觸即發。
下午一點左右，泗水的盟軍海軍艦隊突然接到急電：“在馬威安島之西20海里處，發現日本巡洋艦2艘，驅逐艦6艘，運輸艦25艘，在島西北方65海里處，另有日本驅逐艦及運輸艦數艘，該船團后方尚有日本巡洋艦1艘。”
杜爾曼將軍立刻指揮艦隊出擊，盟軍艦隊由下列艦只組成：英驅逐艦“伊勒托拉”、“周比特”、“英康特”擔任前衛，杜爾曼親率巡洋艦“魯特”、“厄克塞特”、“休斯敦”、“伯斯”、“爪哇”為中路艦隊，左翼是荷蘭驅逐艦“威斯”、“厄佛仙”、“喀登涅”，4艘美國驅逐艦“愛德華”、“福特”、“阿爾丹”、“保羅詹斯”為后衛，以一派威武雄壯的氣勢，浩浩蕩蕩的駛出泗水港。
日本入侵部隊分成兩個艦群，一支包括41艘運輸艦在內的東部入侵艦隊，由海軍少將西村指揮，旗艦是“那柯”號。另一支是由海軍少將高木指揮的龐大艦隊，旗艦是“那智”號。
這場海戰爆發的頗具戲劇性，當日軍艦隊的偵察機在報告發現盟軍艦隊時，高木少將感到十分吃驚，由于兵力分散，當時日軍只有2艘重巡洋艦，2艘輕巡洋艦和14艘驅逐艦。從兩軍實力的比較來看，日軍并不占優勢，但在其它方面，日軍占有優勢，杜爾曼的通訊能力比較差，沒有飛機去進行偵察，而日軍卻不斷的用飛機進行偵察。
而且盟軍的官兵在戰斗崗位上已達近2天的時間了，不少人已筋疲力竭，杜爾曼在給赫爾弗里的一份電報中提到：“我的部屬的耐力已達到極限，很快就要超過限度。”
爪哇海戰是盟軍在海上的再一次失敗，經過半天的戰斗，盟軍損失慘重，“魯特”和“爪哇”兩艘巡洋艦皆因閃避不及而被魚雷命中，燃著大火壯烈的沉沒了。“魯特”上的杜爾曼少將本可以搭乘救生艇離開險境，但他選擇了與“魯特”一起沉入大海的決定，壯烈殉職。
另外，盟軍的多艘戰艦被擊傷擊沉，原本強大的海軍艦隊在很短的時間內分奔離析。這一戰，盟軍保衛爪哇島的海上力量幾乎崩潰。(