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小丑放走了丹特之后，炸毀了丹特所在的醫院。同時，歷盡千辛萬苦才死里逃生的瑞斯，卻落入了小丑的手中，小丑通過瑞斯再次向人們宣布，天黑之后，這座城市就是他的了，所有留在哥譚市的居民都必須遵守他的規則。如果不想參加這場游戲，現在就離開哥譚市。但是橋梁和隧道會有驚喜。
此時恐怖的威脅已經開始輻射到每一個人的心底，這是生死的抉擇，沒有人想要死。而丹特則開始了自己的報復行動，他首先找到了開車將他送入小丑手中的警，察一一也就是馬諾尼的線人，丹特旋轉著手中的硬幣，如果出現燒焦的一面，那么就是死亡，如果出現了干凈的人頭一面，他就將饒他一死。結果這名警察被處決了，隨后，丹特開始一一質問并處決所有貪污的警察和幫派份子。雙面人開始發威了。
韋恩再次變身成為蝙蝠俠，他私下開發了聲納設備，利用城市里所有人的手機設備當做信號塔，達到監視城市每一個居民的效果，只要小丑通過城市的任何一部手機通話，這個設備就定位精準定位到他的位置。這侵犯到了個人的隱私，但蝙蝠俠卻愿意不顧一切地捕捉到小丑。福克斯被韋恩設定為唯一一個能夠使用這個設備的人，蝙蝠俠希望福克斯能夠幫助他，無奈之下，福克斯答應了這個要求。但同時福克斯表示，只要這個設備還在公司，他就不會在公司繼續留任。對此，蝙蝠俠的回答是，“當你結束之后，輸入你的名字。”
因為小丑的炸彈威脅，政府開始以輪渡撤離民眾，整座城市出現了大遷徙，壯觀的場面比上班高峰期還要壯觀十倍百倍。率先出發的兩艘輪渡上，一艘載著民眾，另一艘則是囚犯，這讓被困在碼頭的城市居民怨聲載道，因為他們認為應該先讓守法公民乘坐輪渡，囚犯必須留在最后 在這一刻，人性自私的本質就再次顯露了出來。不過很快，坐上輪渡的人也開心不起來了，輪渡在河邊上停止了運轉，小丑的聲音在這時響了起來。原來，他在兩艘輪渡上都安置了炸彈，而炸彈的引爆裝置就在對面的那艘船上，他們自救的方法，就是用自己船上的引爆器去引爆對面的船只，否則，兩艘船都會在午夜時分被遙控引爆。
到底是罪犯們被內心的邪惡所侵占，搶先按照引爆裝置求生；還是守法的公民們按照道德的準則去“處決“對面的犯人們呢？
這是人性的極限挑戰！在電影院的現場，可以清晰地聽到觀眾們倒吸一口涼氣的聲音，小丑的安排太過精密也太過可怕！
守法公民們首先混亂了起來，“我們不應該死，那些人已經有過機會了，“即使有負責轉移的士兵壓制，士兵們不希望眾人動搖，他們是不會主動按下引爆裝置的，但現場所有公民都開始反對，求生意識占據了上風，更何況對面的輪船上都是罪犯，平時滿口的“人權平等“、“廢除死刑“在此時此刻都變得不值一提，自己的生命才是最重要的，哪怕是以對方生命為代價，更何況，他們都沒有這份信任，對面輪船上的人不會按下引爆裝置。人性在這一刻徹底的爆發了出來，沒有人能夠荊斷他們做的是對還是錯。“我們應該投票！“這是守法公民們最后的決定。
戈登在蝙蝠俠的指示下，找到了小丑所處的大樓，狙擊手都已經就位，他們隨時都可以射殺小丑，不僅是為了救輪渡上的人，同時也是為了就下丹特，他們心目中的光明騎士。但他們所不知道的是，丹特根本不在小丑手上，丹特已經徹底成為了雙面人，陷入了瘋狂，他將戈登的妻子和兒子都抓走了。與戈登站在現場的蝙蝠俠卻認為小丑絕對沒有那么簡單，他希望自己能夠有五分鐘去探查一下。在蝙蝠俠的強硬面前，戈登決定再給小丑兩分鐘。
蝙蝠俠抵達對面大樓之后，發現站在窗口帶著小丑面具，被戈登等人認為是目標的這些人，根本不是敵人，而是人質，他們的嘴巴都被膠帶封住，帶上了面具，手上也被纏著手槍，是被故意豎起來的槍靶子。可是戈登不知道，特警隊也不知道。于是，蝙蝠俠在尋找小丑之前，就必須先把人質從特警隊手中救下來。
正當蝙蝠俠在尋找小丑的時候，輪渡上的投票已經出來了，守法公民們選擇了按下引爆裝置，但卻沒有人愿意去當這個殺人兇手，沒有人愿意用自己的右手按下引爆裝置，此時距離午夜十二點只剩下五分鐘，小丑說過，午夜時他會親自按下引爆裝置。一名船員的話讓守法公民們都安靜了下來，“我們都還活著，這說明他們也沒有按下引爆器”
犯人輪船上，氣氛更加緊張，犯人們都站立了起來，沒有人愿意坐著等死。一名強壯的犯人站了起來，走到了手持引爆器的猶豫不決的警察面前，殘忍地說到，“你不想死，但你也不知道怎么去取別人的性命，把它給我。“犯人的語氣格外溫柔，就好像在面對自己的情人，“否則這些人會殺死你，你一樣也要死。”
守法公民之中一名中年男子說到，“沒有人想臟了自己的手。
好，我來做。“他站了起來，走向了手握引爆器的士兵，“對面船上的人已經做出了他們的選擇，他們選擇了偷搶燒殺，我們沒有任何理由也去死。“他大氣凜然地拿起了引爆器 雖然守法公民和犯人說的都沒有錯，但是電影院的觀眾沒有人愿意承認：這就是對的在生死攸關的決定面前，人性的自私、人性的丑陋都被展露無遺。雖然觀眾們不愿意承認，但他們都知道，小丑贏了，小丑就這樣輕而易舉地將人性玩弄于鼓掌之間，將蝙蝠俠玩弄于鼓掌之間。
警，察把引爆器交給了犯人，這意味著，他也對內心的求生妥協了，他不想自己做決定，于是他把引爆器一一這個可以決定另外一船人生死的武器交給了犯人，這和等同于謀殺又有什么區別？但隨后，犯人卻直接把引爆器從窗口扔了出去。
在這一刻，人性到底是善還是惡，沒有人分得清楚，誰說犯人們就喪心病狂？至少在犯人輪船上，最終做出正確選擇的，不是那些自詡正義的警察們。這一幕所帶來的沖擊，居然扔人的眼眶里隱隱含著淚光。沒有人能夠如此坦然，所有人都知道；而此時冒出來的淚水，是內疚是恐慌是遺憾還是悲傷，卻沒有人能夠分辨出來。
另外一方面，守法公民的輪船上，中年男子顫抖著自己的手拿起了引爆器，握住了引爆的鑰匙，卻始終無法狠下決心，他看向了那不斷走向十二點的時鐘，最終還是放下了引爆器。輪船上沒有人說話，即使剛才他們投票之后，認為他們應該按下引爆器，但事實卻告訴他們，一切沒有那么簡單。無論是自己引爆，還是犯人輪船上的沒有任何動靜，都在說明了，人性的掙扎遠遠比想象痛苦難熬。
蝙蝠俠終于找到了小丑，并且展開了激烈的打斗，占據了上風的小丑卻停下了自己的動作，他期待著輪船的引爆所帶來的煙火，但他失望了。在這一刻，向來自信不羈的小丑，臉上露出了一絲不易察覺的恐慌，他失算了。此時已經十二點了，小丑決定親自引爆兩艘輪船。
“你到底想證明什么，證明每一個人內心都像你一樣丑陋？你沒有同類了。“蝙蝠俠打擊著小丑的信心。
“如果不能靠別人，什么事都必須親自來，不是嗎？“小丑第一決失去了方寸，他有些氣急敗壞地拿出了。袋里的引爆器，“這個世界真可笑，你知道我這些傷疤怎么來的嗎？”
正當所有觀眾都以為小丑又要說一次故事時，蝙蝠俠卻發動了手腕上的暗器，然后一下就把壓在自己身上的小丑掀翻了過去。小丑就從高樓上直接掉了下去，沒有任何保護措施的小丑卻絲毫沒有恐懼，相反他驚悚尖銳的笑聲在空中不斷回蕩蝙蝠俠終究沒有辦法突破自己的底線，他發生了鋼絲繩吊住了即將落地的小丑，并且把小丑救了上來，吊在半空中。
“哦，你，你就是不能放手讓我死，不是嗎？“小丑顯得很失望，“你果真不會動搖，是不是？你不會殺了我，是因為你錯誤的自以為是的正義感；我也不會殺了你，因為你太好玩了。“小丑就這樣被吊在半空中，張開雙臂，像一只自由翱翔的小烏，享受著狂風穿過手臂的快樂，“這座城市的居民遲早都會發瘋的，直到他們的精神完全崩潰，直到他們看清真正的哈維一丹特！”
即使被吊在了半空中，小丑依舊將蝙蝠俠耍的團團轉，“你不是真以為我會把哥譚的靈魂之戰的成敗寄托在與你的打斗上吧？我把哥譚的光明騎士，拉到了我們的這個層次上。你看，瘋狂就好像地心引力一般，需要的只是，輕輕的一堆。
“小丑那張狂恐怖的笑聲在夜空里不斷回蕩，讓每一個人的身上都冷汗直冒。
在瑞秋被炸死的廢墟里，丹特綁架了戈登的妻子和孩子，并且將戈登擊倒在地，此時的丹特已經被憤怒完全吞噬了，他責備戈登因為不配合抵抗內部調查，所以才導致了他的團隊里有線人滲透，這才導致了瑞秋的死亡和他成為了雙面人。
陷入了瘋狂的丹特開始用擲硬幣的方式來決定他自己、蝙蝠俠和戈登兒子詹姆斯的生死。“這不是我想不想的問題，這是公平與否的問題。你認為我們能在一個不正派的時代里當一個正派的人？但你錯了。世界是殘酷的，這個殘酷世界唯一的道德就是幾率。沒有偏見，沒有成見，公平！”
丹特拋擲硬幣，決定了蝙蝠俠的生死，他朝蝙蝠俠的腹部開了一槍；隨后丹特第二次拋擲硬幣，決定他自己的生死，他活下來了；最后，丹特第三次拋擲硬幣，決定詹姆斯的生死，但就在這時，蝙蝠俠撲倒了丹特和詹姆斯，三個人一起往外面墜落下去。硬幣落到了地面上，運氣站在了詹姆斯這邊，是正面人頭。但沒有人會把命運交給幾率和運氣，蝙蝠俠挽救了詹姆斯，而丹特直接下落，隨后蝙蝠俠也因為脫力而掉了下去 蝙蝠俠因為有裝備，活了下來，丹特卻因此而喪生。
所謂的正義，在小丑的謀劃面前準確而言是在人性面前，其實根本不值一提，人們平日里滿口的正義只是構建在事不關己的基礎上，當自己也成為事件的一部分時，人性勢必將站在道德的至高點，自私，在很多時候其實不是貶義詞，是每一個人的本能。在小丑的策劃之中，蝙蝠俠、丹特、戈登，還有兩艘輪船的人，包括哥譚鎮的所有居民，都在面臨著自己本性的掙扎，沒有人能夠意外這才是小丑最高明的地方。
“小丑贏了，丹特的檢舉，他所對抗的一切，都付諸東流了。“戈登知道，一切都已經無法挽回了，“你給予哥譚的任何希望都會隨著丹特的身敗名裂而消亡了。我們都寄望于他，但小丑卻帶走了他，毀滅了他。人們會失去希望“這才是小丑的真實目的，所有的混亂，不過才僅僅是一個開始而已。
“不會的，“蝙蝠俠終于知道自己該怎么做了，“你們永遠不會知道他做的事。小丑不能贏！“蝙蝠俠蹲下來，將丹特面目猙獰的那一面轉了過去，變成了美好形象的那一面，“哥譚需要真正的英雄或者是作為英雄戰死，或者是茍活到目睹自己被逼成壞人“蝙蝠俠選擇了自己抗下丹特所有的謀殺罪名，以維持丹特“光明騎士“的形象 同時，完成了自己使命的福克斯，按照韋恩的要求輸入了自己的名字，發現整個監控程序自我毀滅了，這讓他露出了笑容。
在故事的最后，不得已之下，戈登發出了蝙蝠俠的追捕令，砸毀了蝙蝠信號燈，并給了蝙蝠俠“黑暗騎士”的稱號。