六月十五日，在杭州灣的海面上，停靠了數以百計的戰船，但明顯的分出兩大陣營，分別飄揚著“商”字和“鄭”字的大旗，顯得涇渭分明。
鄭芝龍的坐船“升龍”號，是一艘一千五百料的三桅大船，一共裝載了三十六門火炮，但依然還是福船式的造型，同樣等級的戰船，在鄭芝龍的艦隊中，還有十一艘，在海面上一字排開，頗有威勢。
相比之下，商家軍的大船數量就要少得多，能夠與之相抗衡的，只有二級戰列艦銀河號，六艘巡洋艦，和剛服役的巨鯨號這八艘戰艦。不過從體形上來說，銀河號和巨鯨號這兩艘明顯是鶴立雞群，比鄭芝龍艦隊的所有船只都大出一號，由其是銀河號左右舷邊，一共九十二門火炮，也足以震懾全場。盡管在船舷上，龜山島海戰之后，留下的痕跡還沒有修膳完整，但在有經驗的人眼中，這卻是久經戰場的像征，表示這一艘巨艦并非只是靠外表嚇人。
而從船型上看，鄭芝龍的艦隊都是一色的中式福船樣式，而商家軍的船隊，卻是中西結合，各占半數。而在船隊之間，還有六艘飛剪船，正在各船之間來回穿梭航行，靈活自如，就像游魚一樣。
這時鄭芝龍坐在船頭，凝視著對面的艦隊，還是不動聲色。而他左邊的兄弟鄭鴻逵卻忍不住道：“好家伙，這么多干糸臘的帆船，看來商毅沒有說假話，他真的是把干糸臘人的船都奪了。”
鄭芝豹道：“干系臘人的船到是沒什么，但剛才那幾條引路的什么船，競然會有這樣快的速度，就連紅夷毛人的船也趕不上。我可從來還沒有見過這個樣的船。”
鄭鴻逵也道：“是啊，好快的船，幸好都是小船，如果大船都有這樣的速度，那就太可怕了。”
這時鄭芝龍的部將鄭彩走過來，道：“大人，船己經下錨了，我們下船吧。”
鄭芝龍點了點頭，道：“好，鴻逵、明儼，你們就留在船上，其他人跟我上岸。”
這時商毅早己經在海邊搭好了棧橋，因此就算是“升龍”號這樣的大船，也能夠直接停靠。而商毅這時己經人在棧橋上迎候。
早在去年西班牙遠征軍到達中國的時侯，鄭芝龍就收到了消息，他當然也十分緊張，西班牙遠征軍的戰船雖然只有六十多艘，但鄭芝龍久和歐州人打交道，知道西式戰船操作靈活、速度快，火炮數量多，一艘戰船往往可以抵數艘明朝的戰船。而且士兵的訓練嚴格，紀律嚴明，實在是勁敵。這次進攻中國，確實來者善啊。
因此鄭芝龍也不大意，按他的估計，想要對抗這支西班牙遠征艦隊，至少要集中三百艘戰船，而且至少也要全是四百料以上的大船才行。雖然鄭芝龍的戰船號稱數以千計，其實大部份都是商船，最多架上兩門炮，就成了戰船，想要湊齊三百艘戰船，也不是短時間的事情。于是也立刻下令，調集船只。
結果還沒等鄭芝龍湊齊戰船，就又聽到消息，西班牙遠征軍巳經被浙江的明軍擊敗了。這下鄭芝龍也吃驚不小，而且還有些半信半疑，他和這個時代的大多中國人不同，對海外的世界十分了解，僅僅只是浙江的明軍，怎么可能擊敗西班牙遠征軍呢？因此又派人到浙江打探。
商毅擊敗西班牙遠征軍的消息在明朝雖然沒有引起什么轟動，但在浙江還是頗有些影響力的，因此鄭芝龍很快就打聽到了商家軍擊敗西班牙遠征軍的整個過程，雖然其中不乏夸大其詞，但也有五六分真實。鄭芝龍雖然覺得有些難以理解，但事實己經擺在眼前，也不由他不信。同時也注意到商毅這個人。
當然這個時候商毅才剛剛始建立海軍，還沒有向海外擴張，打敗西班牙遠征軍，也是靠的陸戰，因此鄭芝龍對他也并沒有生出警惕之心。
但在過年之后，商毅進軍臺灣，逐驅西班牙，與荷蘭人達成共駐臺灣，以及貿易的協議等等消息，也都陸續傳到了鄭芝龍的耳中，這才讓鄭芝龍生出戒意來。因此也派人重點打探商毅的情況，不僅了解了商毅過去的一系列戰績，己佳占穩了浙江，還進入蘇州的絲綢業，而且還知道現在商毅的手下不僅有一支規模頗大的海軍，同時還在杭州建立了造船廠，向海外擴張的意圖己經十分明顯了，鄭芝龍這才感覺到商毅的危脅。
按照鄭鴻逵的打算，應該立刻出兵，攻打臺灣，把基隆奪過來，并狠狠教訓商毅一頓，也讓他知道，在海面上是鄭家說了算，在鄭家持這種觀點的人也不在少數。
但鄭芝龍到底要比別人考慮得深了一層，他知道商毅不同于自己以前的敵人，在過去，無論是劉香還是李魁奇，都是海盜身份，而鄭芝龍接受了明朝的招安之后，搖身一變也成為朝廷官員，不僅能在沿海獲得立足之地，用時也得到了明朝在人力物力上的大力支持，因此在與他們的海上爭斗中，也占盡了優勢，最終成為最后的嬴家，對荷蘭人的戰斗也同樣是如此。在這一點上，鄭芝龍比劉香、李魁奇等人明顯要高明得多。
因為商毅也是朝廷官員，官職比鄭芝龍還高，在朝中似乎還有不小的靠山，同時商毅還是浙江總兵，鄭芝龍有很大一部份商品都是從浙江購買，一但和商毅惡交，對鄭芝龍的商業影響也很大。而且從商毅過去的戰績來看，顯然和一般的眀軍大不相同，那怕這些戰績只有一半是真的，鄭芝龍也沒有戰而勝之的把握。因此用過去對付劉香、李魁奇等人的辦法來，以武力來對付商毅，顯然是行不通的。
而就在這時，北京失守，崇禎架崩，南京朝廷建立等一系列消息也都傳到了泉州，在這種動蕩的時刻，鄭芝龍也不得不把精力放在南京朝廷上，因此也只能放棄對商毅的關注。朱由崧登基之后，封鄭芝龍為安南伯，鄭鴻逵為靖魯伯，并駐守鎮江，按明朝的規據，鄭芝龍應該親自到南京去面見新皇帝謝恩。
不過在詔書傳到泉州的之后，鄭芝龍也知道商毅現在已經由南京朝廷封為臨邑候，并受任浙江巡撫，在南明朝廷中的地位可以說是舉足輕重，因此對商毅也更為忌憚，于是也打算趁著這次進南京的機會，借路過浙江之機，見一見商毅，看看他到底是怎么樣的一個人，然后再決定對付他的辦法。
在昨天鄭芝豹從杭州返回鄭芝龍的船隊，也把自己在杭州的所見所聞向鄭芝龍匯報了一遍，鄭芝龍雖然當時不置可否，但心里確實吃驚不小。而現在在杭州海面上，見到商家軍海軍的這個陣勢，鄭芝龍心里也清楚，商毅的海軍實力絕對不弱，雖然說還沒有超過自己，但也相差不遠了。因此在心里也暗暗盤算，應該怎樣與商毅交涉。
鄭芝龍在下屬的簇擁下，從船上下來之后，踏上了棧橋，這時商毅己經迎了上來，見鄭芝龍四十歲上下年紀，細眉長目，相貌頗為斯文，雙手抱拳，拱手施禮道：“鄭總兵，久仰大名。”
論官職兩人都是總兵，但爵位鄭芝龍還要比商毅低一級，而且商毅還是巡撫，因此在禮儀上鄭芝龍是低于商毅的，雖然鄭芝龍并不看重官職，但剛才看到了商毅顯示出的海上實力，對他也不敢小視，而見商毅也只是二十五六上下的年紀，更是驚異，也趕忙還禮，道：“商總兵，豈敢、豈敢。”
商毅笑道：“鄭總兵今天到浙江來，聲勢浩大，莫非是來向我興師問罪而來嗎？”
鄭芝龍怔了一怔，但他也是見慣了場面上的人，立刻道：“商總兵說笑了，芝龍這次是進京面君謝恩，只因海面上盜賊眾多，才多帶了幾艘船來，豈敢向商總兵問罪。”
商毅道：“誰不知道在海面上盜賊早己被鄭總兵剿滅殆盡，如今萬里海疆以然平安無恙，又怎么會有盜賊呢？”
鄭芝龍指了指商家軍的戰船，淡淡道：“商總兵過講了，如果早知商總兵有如此雄武水師，那還用得著害怕什么盜賊，我也就可以安心出海，不用弄得興師動眾了。”
商毅不禁大笑道：“鄭總兵，請恕我直言，誰不知道如今這海上盡是鄭總兵麾下的海舶，無論是中夷商船若是不得鄭氏令旗，更不能出海。但我商毅初到浙江，卻從中硬插了一桿子進來，任誰也會來興師問罪。就是換了是我，也同樣不會罷休的，我說的對嗎？”
鄭芝龍沒想到商毅會這么直接，雖然是見慣了各種場面，但一時之間也不知該如何回答商毅，因此也只好干笑了兩聲，逍：“商總兵到真會開玩笑。”
商毅也不禁笑了一笑，沒有繼續說下去，道：“鄭總兵，我己經在杭州城中安排下宴席，請鄭總兵上岸一敘。”說著伸手作了一個請的手勢。
鄭芝龍也同樣作了一個請的手勢，道：“如此，就討僥商總兵了。”